Carleton előbb a meszkalero-apacsok ellen vonult, akik ezren sem lehettek; elszórtan, kis csoportokban éltek a Rio Grande és a Pecos között. Carleton terve az volt, hogy mind egy szálig legyilkolja vagy foglyul ejti a meszkalerókat, s az életben maradottakat a Pecos melletti sivár rezervátumba kényszeríti. Ha ezt elvégezte, a gazdag Rio Grande völgyet felparcelláztatja, s amerikaiakkal telepítteti be. 1862 szeptemberében parancsot köröztetett:
"Az indiánokkal tanácsban nem tárgyalunk, szóba sem állunk velük. A férfiak lemészárlandók, bárhol és bármikor mutatkozzanak is. A nők és a gyermekek természetesen életben hagyandók és foglyul ejtendők."